Depuis 1986, l'ATHAREP s'attache à promouvoir l'insertion de personnes handicapées dans les organismes de recherche, les grands établissements et les universités.

Avec le soutien du Ministère de la Fonction Publique, l'ATHAREP a créé une structure d'appui au recrutement des diplômés handicapés, « Agir pour l'Insertion ».

Interlocuteur privilégié du Ministère de la Fonction Publique et de l'Education Nationale dont elle reçoit le soutien, l'association développe depuis lors un partenariat avec les autres Ministères (Agriculture, Emploi, Santé, Ecologie, Equipement, Intérieur...).